理工學(xué)院學(xué)生隋昊臣在Biomolecules期刊上發(fā)表論文
? ? ? ? 香港中文大學(xué)（深圳）理工學(xué)院本科生隋昊臣同學(xué)（2015級(jí)統(tǒng)計(jì)學(xué)與數(shù)據(jù)科學(xué)專(zhuān)業(yè)）與朱寶亭教授的學(xué)術(shù)論文在Biomolecules期刊上成功發(fā)表。
? ? ? ? Biomolecules 生物分子（ISSN 2218-273X）是一本國(guó)際同行評(píng)審的開(kāi)放獲取期刊，專(zhuān)注于生物物質(zhì)及其生物功能、結(jié)構(gòu)、與其他分子的相互作用，以及它們的微環(huán)境以及生物系統(tǒng)。期刊目前位于生物化學(xué)與分子生物領(lǐng)域Q1區(qū)，影響因子為4.6。
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作者檔案
? ? ? ? 隋昊臣
? ? ? ? 學(xué)院：理工學(xué)院
? ? ? ? 書(shū)院：學(xué)勤書(shū)院
? ? ? ? 專(zhuān)業(yè)：統(tǒng)計(jì)學(xué)與數(shù)據(jù)科學(xué)
? ? ? ? 高中：四川省成都七中
? ? ? ? 隋昊臣同學(xué)是我校理工學(xué)院四年級(jí)統(tǒng)計(jì)學(xué)與數(shù)據(jù)科學(xué)專(zhuān)業(yè)學(xué)生，本論文的共同第一作者，其高中畢業(yè)于成都七中。隋同學(xué)于大二下學(xué)期進(jìn)入了朱寶亭教授的藥物開(kāi)發(fā)實(shí)驗(yàn)室。目前，他已有一篇一作論文發(fā)表，一篇一作論文接收。他的研究領(lǐng)域包括數(shù)據(jù)科學(xué)，機(jī)器學(xué)習(xí)，計(jì)算生物，量子化學(xué)以及量化金融。
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隋昊臣同學(xué)（左）與到時(shí)朱寶亭教授（右）
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導(dǎo)師簡(jiǎn)介
? ? ? ? 朱寶亭教授
? ? ? ? 朱寶亭教授現(xiàn)任香港中文大學(xué)（深圳）理工學(xué)院副院長(zhǎng)，教授。他的研究領(lǐng)域涵蓋基礎(chǔ)分子藥理學(xué)、腫瘤藥理學(xué)、及疾病分子機(jī)理學(xué)。主要研究重點(diǎn)是關(guān)于甾體激素及食源性化合物在癌癥預(yù)防和治療中的作用以及它們?cè)诩?xì)胞和分子水平上的作用機(jī)理。他已在國(guó)際上以第一或通訊作者發(fā)表了近130余篇高質(zhì)量科學(xué)論文，引用約8000次。
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論文介紹
? ? ? ? 發(fā)表期刊：Biomolecules
? ? ? ? 期刊簡(jiǎn)介：Biomolecules 生物分子（ISSN 2218-273X）是一本國(guó)際同行評(píng)審的開(kāi)放獲取期刊，專(zhuān)注于生物物質(zhì)及其生物功能，結(jié)構(gòu)，與其他分子的相互作用，以及它們的微環(huán)境以及生物系統(tǒng)。期刊目前位于生物化學(xué)與分子生物領(lǐng)域Q1區(qū)，影響因子為4.6。
? ? ? ? 論文題目：Stimulation of the Production of Prostaglandin E2 by Ethyl Gallate, a Natural Phenolic Compound Richly Contained in Longan
? ? ? ? 論文摘要：本文通過(guò)結(jié)合生物實(shí)驗(yàn)與計(jì)算模擬的方式，探究了環(huán)氧化酶（COX）蛋白中的過(guò)氧化物酶催化和再激活的分子機(jī)理，并首次發(fā)現(xiàn)沒(méi)食子酸乙酯類(lèi)藥物小分子在進(jìn)入下圖所示的COX蛋白位點(diǎn)之后，可以通過(guò)電子轉(zhuǎn)移等機(jī)理產(chǎn)生藥效作用，進(jìn)而促進(jìn)相關(guān)蛋白酶的再次活化并有效防止其發(fā)生自殺失活現(xiàn)象。因?yàn)闆](méi)食子酸乙酯是龍眼中的主要功能化合物之一，所以本研究為龍眼具有“生火”的藥理作用提供了分子機(jī)理和解釋。另外，本文的發(fā)現(xiàn)對(duì)設(shè)計(jì)以COX為靶點(diǎn)的新型藥物具有指導(dǎo)意義和參考價(jià)值。
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對(duì)話(huà)
? ? ? ? Q1:?開(kāi)始這篇論文的契機(jī)是什么？這篇論文是有關(guān)酸乙酯和生物酶的研究，學(xué)長(zhǎng)的專(zhuān)業(yè)是統(tǒng)計(jì)學(xué)與數(shù)據(jù)科學(xué)，在研究當(dāng)中負(fù)責(zé)哪一個(gè)部分，專(zhuān)業(yè)知識(shí)給了你哪些幫助？
? ? ? ? A1:?我認(rèn)為能開(kāi)始這篇論文乃至我所負(fù)責(zé)的整個(gè)項(xiàng)目的契機(jī)便是一個(gè)人的自主科研能力與主動(dòng)與教授交流的能力。
? ? ? ? 在自主科研方面，因?yàn)槲业谋究剖菙?shù)據(jù)科學(xué)專(zhuān)業(yè)，但是整個(gè)諾獎(jiǎng)研究院的科研方向?yàn)樗幬镩_(kāi)發(fā)，缺少足夠的生物知識(shí)讓我在科研起步階段感覺(jué)到了很大的壓力。我當(dāng)時(shí)的做法是搜集與我課題相關(guān)的各種期刊論文，進(jìn)行逐一詳細(xì)閱讀標(biāo)記，記錄其論文中操作的關(guān)鍵點(diǎn)，并通過(guò)自學(xué)進(jìn)行驗(yàn)證。整個(gè)科研過(guò)程中，我基本上將空閑時(shí)間全部投入到了實(shí)驗(yàn)室的工作中，經(jīng)常一下課便去實(shí)驗(yàn)室繼續(xù)數(shù)據(jù)測(cè)試。在這樣的高強(qiáng)度自學(xué)過(guò)程中，便會(huì)發(fā)現(xiàn)自己對(duì)項(xiàng)目的理解和對(duì)問(wèn)題的直覺(jué)會(huì)大大提升。
? ? ? ? 在主動(dòng)與教授交流方面，因?yàn)楦邚?qiáng)度的自學(xué)必然會(huì)帶來(lái)許多自己無(wú)法解決的生物方面問(wèn)題，我每天會(huì)主動(dòng)聯(lián)系朱教授進(jìn)行一對(duì)一的問(wèn)題探討。其實(shí)和朱教授這樣的大牛保持每天的交流是我整個(gè)項(xiàng)目成功的最重要的一點(diǎn)。在和朱教授交流的過(guò)程中，一些自己的疑惑點(diǎn)會(huì)被迅速解答，一些潛在的未知問(wèn)題可以得到很深入的分析建議。同時(shí)，教授的經(jīng)驗(yàn)保證了我在項(xiàng)目的前進(jìn)道路上不會(huì)走偏，大大提高了我的科研效率。
? ? ? ? 在這樣的科研積淀中，通過(guò)不斷的交流和學(xué)習(xí)，便會(huì)開(kāi)始嘗試解決一些目前科研界尚未解決的問(wèn)題點(diǎn)，這些問(wèn)題點(diǎn)也最終成為了我推進(jìn)項(xiàng)目的目標(biāo)與動(dòng)力所在。
? ? ? ? 我們的實(shí)驗(yàn)室大體可以分為實(shí)驗(yàn)組和計(jì)算組。我在研究中主要負(fù)責(zé)整個(gè)計(jì)算建模的工作。我的計(jì)算方面工作包括統(tǒng)計(jì)建模分析，生物數(shù)據(jù)挖掘，生物分子對(duì)接模擬，分子動(dòng)力學(xué)模擬和量子化學(xué)計(jì)算。我們需要學(xué)會(huì)利用數(shù)據(jù)對(duì)潛在的生物藥物分子進(jìn)行前期篩選，利用計(jì)算生物軟件對(duì)篩選出的藥物分子進(jìn)行蛋白質(zhì)測(cè)試動(dòng)態(tài)模擬以及利用量子化學(xué)軟件對(duì)模擬的各種化學(xué)參數(shù)進(jìn)行計(jì)算預(yù)估。
? ? ? ? 可能很多人會(huì)覺(jué)得數(shù)據(jù)科學(xué)和生物不怎么掛鉤，但是我對(duì)數(shù)據(jù)科學(xué)的理解為其就是一個(gè)工具包，需要我們將其應(yīng)用到各種領(lǐng)域去，而生物便是我所發(fā)現(xiàn)的數(shù)據(jù)科學(xué)一大應(yīng)用領(lǐng)域。首先，數(shù)據(jù)科學(xué)培養(yǎng)了我對(duì)數(shù)據(jù)的一種敏感性，所以在面對(duì)大量生物數(shù)據(jù)的時(shí)候，我會(huì)很容易地發(fā)現(xiàn)數(shù)據(jù)之間的關(guān)系并選擇合適的模型進(jìn)行搭配測(cè)試。其次，數(shù)據(jù)科學(xué)本身就需要我們有很強(qiáng)的技能組合能力，所以其讓我能將數(shù)據(jù)挖掘建模，計(jì)算生物模擬，量子化學(xué)計(jì)算三大計(jì)算版塊有效的結(jié)合起來(lái)并測(cè)試出最佳計(jì)算方案。
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? ? ? ? Q2:?作為一名數(shù)據(jù)科學(xué)的大四學(xué)長(zhǎng)，你對(duì)學(xué)弟學(xué)妹們有什么建議嗎？在咱們學(xué)校學(xué)習(xí)的這三年，你覺(jué)得自己最大的改變是什么？收獲是什么？遺憾又是什么？
? ? ? ? A2:?作為一名數(shù)據(jù)科學(xué)的學(xué)生，我覺(jué)得數(shù)據(jù)科學(xué)最重要的就是要多去應(yīng)用。課堂上我們會(huì)學(xué)到一些統(tǒng)計(jì)，機(jī)器學(xué)習(xí)，數(shù)據(jù)庫(kù)等的理論知識(shí)，但這是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的。我們學(xué)校有各種各樣可以利用到我們專(zhuān)業(yè)知識(shí)的科研項(xiàng)目，我們應(yīng)該主動(dòng)去聯(lián)系相關(guān)的教授，多去嘗試一些科研項(xiàng)目方面的應(yīng)用。同時(shí)，網(wǎng)絡(luò)上目前也有許多數(shù)據(jù)科學(xué)方面的全球性競(jìng)賽，我們?cè)陂e暇的時(shí)候可以多去參加一些比賽，積累比賽中的各種建模方法，這樣也有助于我們更好的理解自己的專(zhuān)業(yè)知識(shí)。
在學(xué)校的這三年，我覺(jué)得自己最大的改變就是主動(dòng)性強(qiáng)了很多，敢于主動(dòng)去找大牛教授們直接交流想法問(wèn)題，敢于直接參加一些大型活動(dòng)積累自己的人脈，同時(shí)在課程學(xué)習(xí)的基礎(chǔ)上也能主動(dòng)去嘗試一些挑戰(zhàn)來(lái)增強(qiáng)自己的知識(shí)儲(chǔ)備。我覺(jué)得這種能力的收獲是十分寶貴的，但也正因?yàn)樵谙愀壑形拇髮W(xué)（深圳），才讓我有了更多的可能讓自己發(fā)生蛻變。當(dāng)然遺憾就是自己快要畢業(yè)了哈哈。
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文案：劉浩翔（2017級(jí)理工學(xué)院、思廷書(shū)院）
